Evangelion: 3.0 + 1.0: Thrice Upon A Time, o filme “final” de Evangelion, vendeu 5.423.475 ingressos por cerca de US $ 75,72 milhões de dólares na quarta-feira, seu 59º dia na bilheteria japonesa. O filme ultrapassou os cerca de US $ 75.40 milhões de ganhos de Shin Godzilla de 2016 e se torna o filme de maior ganho do diretor Hideaki Anno no Japão.
Em sua terceira semana, o filme superou o faturamento interno de Evangelion: 3.0 You Can (Not) Refo, que arrecadou um total de 5,3 bilhões de ienes. O novo filme é agora o filme de maior receita da série nacional e internacionalmente, apesar de ter sido exibido em apenas um país até agora.
Durante uma apresentação em uma exibição de Evangelion: 3.0 + 1.0 em abril, Anno notou que os fãs poderiam impulsionar o filme além de Evangelion 3.0 e Shin Godzilla para estabelecer um novo recorde para ele. Ele acrescentou que se o filme pudesse ultrapassar 10 bilhões de ienes (cerca de US$ 90 milhões), seria um bom presságio para a revitalização da indústria de anime.
O filme estreou em 466 cinemas no Japão em 8 de março e vendeu 33,6% a mais de ingressos do que o filme anterior de Evangelion durante seus respectivos primeiros sete dias.
O filme estabeleceu um recorde de ganhos IMAX em um dia de estreia no Japão, com o equivalente a US $ 740.000 em ingressos IMAX. O filme também estabeleceu um recorde para a maior porcentagem de receita bruta de estreia IMAX para um filme local no Japão.