É de conhecimento de muitos pessoas que Hideaki Anno tem um passado com o estúdio Ghibli. Ele foi designado pelo próprio Hayao Miyazaki a cuidar de certas cenas em Nausicaä de 1984 . A relação entre Anno e o estúdio é mostrado também no documentário Profissional da NHK (você pode assistir aqui).
Evangelion: 3.0 + 1.0 Thrice Upon a Time foi feito de forma digital em computadores, mas uma certa cena do filme Anno gostaria de fazer de forma analógica. O Estúdio Khara é totalmente digital, mas no Estúdio Ghibli eles ainda têm uma mesa de animação antiga. Células de animação individuais são colocadas na mesa e, em seguida, fotografadas uma a uma.
O estúdio Khara, em seu twitter, publicou um vídeo mostrando o processo utilizando essa mesa analógica:
Fonte: Kotaku